La Dirección es la máxima autoridad del puic, siendo el/la director/a la autoridad ejecutiva y representante legal del Programa. Es también responsable de conducir a la institución, proponer las principales líneas de trabajo, ser el vínculo con la Coordinación de Humanidades y con las autoridades superiores de la Universidad Nacional Autónoma de México. Preside el cuerpo de Gobierno del Programa que delibera con el conjunto de los responsables de áreas y con los consejeros electos, en el seno del Consejo Técnico Académico (Consejo Interno) del mismo.
Corresponde a el/la Director/a del Programa Universitario de Estudios de la Diversidad Cultural y la Interculturalidad: